Hace 65 millones de años cayó un meteorito de 10 km. de diámetro en el norte de la península de Yucatán, cerca de una población llamada Chicxulub que en maya significa “el pozo del diablo”. Éste suceso provocó la extinción de incontables especies en el planeta, entre ellas los dinosaurios, originó la formación de cavernas en el suelo de roca caliza de la península -dando origen a los cenotes- y formó una nube de polvo que durante varios meses impidió la filtración de los rayos solares, lo que provocó una glaciación.

Al formarse el hielo en los casquetes polares disminuyó el nivel del mar y emergió la península de Yucatán, permaneciendo las cavernas secas, colapsandose sus techos, formando lo que hoy conocemos como cenotes. El suelo en la península de Yucatán permite la filtración del agua de lluvia, la cual erosiona la roca caliza del techo de las cuevas y al adelgazarse éste colapsa. Al llegar el agua a una capa de roca volcánica impermeable forma ríos subterráneos.

Existen cuatro tipos de cenotes: Parcialmente abiertos o forma de cántaro, abiertos o caída libre, antiguos cenotes o aguadas y cenotes de tipo caverna. Un gran número de cenotes que han sido acondicionados para poder visitarlos, algunos de los más bellos son: Chelentún, Chaczinicche, Bolonchoojol, Elepetén, Ik kil, Kambulnah, Kankirixché, Nayah, Papakal, Samulá, X-Batún, X-Canché, X'Kekén, Zací y Xcanahaltún.